Universidad de Castilla-La Mancha
 
Escuela Superior de Ingeniería Informática

 

  cambiar a curso:   2015-16   2017-18



Grado en Ingeniería Informática


TRABAJOS FIN DE GRADO
curso: 2016-17

Aplicación para el análisis automático de imágenes de inmunofluorescencia


Tecnologías Específicas

Computación
Tecnologías de la Información
 


Descripcion y Objetivos

La inmunofluorescencia es una técnica de inmunomarcación que hace uso de anticuerpos unidos químicamente a una sustancia fluorescente para demostrar la presencia de una determinada molécula.  El análisis de imágenes microscópicas obtenidas mediante esta técnica consiste en detectar y cuantificar la presencia de estos marcadores.

El trabajo fin de grado propuesto consiste en la elaboración de una aplicación para el análisis de imágenes de este tipo obtenidas en estudios de autofagia. En ellas, ha de determinarse si fluorescencias detectadas en distintos canales de color marcan autofagosomas, autolisosomas, o simplemente actefartos que no son relevantes para el estudio. 

Debido a la variabilidad en las características de cada imagen, e incluso la variabilidad de la intensidad media del color dentro de las mismas, no es posible detectar la fluorescencia mediante la simple aplicación de un umbral, y es necesario recurrir a otras técnicas como la detección de bordes o incluso la clasificación automática de píxels.

Este proyecto se divide en dos partes. En la primera de ellas se diseñará un método automático de identificación de regiones fluorescentes en imágenes. Una vez validado este, se procederá al diseño e implementación del resto de la aplicación, que ha de proporcionar la funcionalidad relativa a manejo de imágenes, generación de informes, y análisis estadístico.

 


Metodología y Competencias

El desarrollo de este trabajo fin de grado se divide en dos partes: el análisis automático de las imágenes y la elaboración de la aplicación. Este trabajo puede dividirse a su vez, en 5 hitos o tareas:

  1. Estudio de las imágenes.
  2. Elaboración de un modelo de detección automática de regiones fluorescentes.
  3. Elaboración de los métodos de extracción de información a partir de las regiones detectadas.
  4. Diseño de la aplicación (interfaz de usuario).
  5. Implementación de la aplicación.
 


Medios a utilizar

Con el fin de que sea más fácil la distribución, y debido a la relativamente poca complejidad de la interfaz de usuario, la aplicación se desarrollará en lenguaje Matlab, utilizando el toolbox para el proceso de imágenes de que dispone esta herramienta.

 


Bibliografía

  • Fundamentals of Digital Image Processing: A Practical Approach with Examples in Matlab. Chris Solomon, Toby Breckon.
  • Essential Matlab for Engineers and Scientists. Brian H. Hahn. Daniel T. Valentine.
  • Documentación y tutoriales para el toolbox de proceso de imágenes de Matlab: http://es.mathworks.com/products/image/
  • Apuntes de la asignatura Diseño de Algoritmos
  • Apuntes de la asigntura Minería de Datos

 

 


Tutor


OSSA JIMENEZ, LUIS DE LA
 

Alumno


SANZ ALONSO, DIEGO FERMÍN
 

 

Sindicación  Sindicación  Sindicación  Sindicación

Curso: 2016-17
© Escuela Superior de Ingeniería Informática
Edificio Infante Don Juan Manuel
Avda. de España s/n
02071 Albacete

informatica.ab@uclm.es
aviso legal
generar código QR de la página